公路: G40,G25,G42,G312等九條高等級公路,長江大橋、二橋、三橋、四橋、五橋(在建)以及長江隧道、揚子江隧道、和燕路過江通道(在建) 3條過江隧道,經開區到市中心僅30分鐘車程,遠期將建成共計24條過江通道。
鐵路:南京站、南京南站、南京北站(在建)、寧啟鐵路、地鐵S8號線(經開區內設有四大站點)。
港口:現有大小碼頭22座,最大停泊能力可達5萬噸級,距西壩港20分鐘車程。
機場:南京祿口國際機場、南京馬鞍國際機場。